Al principio, en Granada, La Corona nombran autoridades que no fueran a plantear conflictos entre las dos comunidades.
Mahammad Abunkay alguacil del Padul.
En 1562 fueron mayordomos Min el Inoz, Lorenzo el Mudéjar y Yazaad El Valete, Alonso Castellanos, Lorenzo el Mandarí e Íñigo de Navas.
Alguaciles este mismo año: Miguel de Mendoza.
El arzobispo de la diócesis era Fray Hernando de Talavera, que incluso llegó a aprender árabe para comunicarse mejor. Llamado por los musulmanes "El Santo Alfaquí mayor de los cristianos"
Pero en 1499 llegó a Granada Fray Francisco Jiménez de Cisneros, para compartir con Talavera la conversión. Este no tuvo tanto celo y empezó a convertir en masa y de forma forzada.
La mezquita del Albaicín la pasó a iglesia. Prendía a quien se le oponía y quemaba los libros árabes que le interesaba. Les obligaba a abandonar sus usos y costumbres y a tomar las cristianas.
En 1500 hay una rebelión en la alpujarra. El rey les planteó bautismo y perdón o castigo. así se dio la conversión forzosa y la práctica a escondidas.
Las prohibiciones aumentaron con Con Dñª Juana y con Carlos V.
Entre el 24 al 31 de diciembre de 1568 la gran insurrección empieza
D. Fernando de Córdoba y de Válor era morisco sobrino de D. Fernando el Zaguer. Se considera de familia descendiente del profeta, estuvo en la cárcel y al salir se fue a Béznar a casa de un pariente.
Farax Ben Farax fue el alma de la rebeldía, responsable de muchas atrocidades cometidas. Acordaron que el primero fuera el rey y el segundo el alguacil. Su elección se hizo en Béznar y luego más tarde al ir a Dúrcal y ver que había una guarnición volvieron hasta Lujar donde volvió a ser coronado.
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La guerra empieza de forma generalizada. Se levanta el Valle el segundo día de pascua (diciembre de 1568) excepto Padul, Dúrcal, Nigüelas, las Albuñuelas y Saleres. |
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Cometieron todo tipo de atrocidades en las Alpujarras. Tomaron Tablate ya que era el único paso hacia el valle de Lecrín. |
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El Marqués de Mondéjar mandó a Diego Quesada que estaba en Dúrcal. Los sublevados habían quemado las iglesias de Béznar y Tablate. En el puente hicieron una huida estratégica y terminaron venciendo a los cristianos. |
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El Padul se convierte en campamento `permanente de las tropas cristianas. |
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El Marqués de Mondéjar llega al Padul con cierta tropa recolectada. se quedaron en las casas a pesar de las quejas de los moriscos paduleños. Esa noche atacan Dúrcal donde habías una guarnición. El alcalde de las Albuñuelas Xaba se rebela y ataca Padul (Agosto). La caballería cristiana que estaba en Marchena, ante la imposibilidad de entrar en Padul, toco las trompetas cerca del Padul haciendo huir a Xaba, pensando éste que eran más de los que realmente venían. |
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Las Albuñuelas no se levantaron al principio por influencia de Bartolomé de Santa María que le hablo de las posibles represalias, pero si lo hicieron animados de ver a los otro pueblos. Saquearon la iglesia. Tras lo cual huyeron a las sierras. Más tarde los moriscos saqueadores intercedieron al Marques de Mondéjar disculpándose por medio de Santa María. |
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Los moriscos de las albuñuelas ayudaban a los rebeldes sin participar ellos directamente. Por lo que desde el Padul Hurtado de Mendoza manda a Don Antonio de luna a saquear las Albuñuelas, de donde vinieron cargados de riquezas y cautivos |
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Un grupo de moros del Valle y Guajares atacó el Padul, dejándolo reducido casi a escombros (21 de febreo de 1570). |
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El Duque de Sesa parte desde Granada por el Padul para atacar a los moriscos estuvo hasta el 9 de marzo esperando refuerzos, junto con Don Juan de Austria terminan con la rebelión. |
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Aben Humeya y su sucesor Aben Aboo terminaron asesinados |
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Los moriscos del Valle fueron expulsados como consecuencia de la carta de Felipe II de 28 de octubre de 1570. Se realizo el 1 de octubre de ese año, fueron encaminados hacia Córdoba y repartidos por Extremadura y Galicia. |
En el Valle fueron:
| Población | Nuevos | Total |
| El Padul | 60 | 260 habitantes |
| Nigüelas | 60 | |
| Restábal | 30 | |
| Melegís | 25 | |
| Murchas | 35 | |
| Cozvíjar | 18 | |
| Béznar | 15 | |
| Lanjarón | 50 | |
| Acequias | 16 | |
| Cónchar | 25 | |
| Chite y Talará | 14 | |
| Saleres | 43 |